Fue Vasco Núñez de Balboa quien atravesó el istmo del Darién para describir el 25 de septiembre de 1.515 el Mar de Sur o del Pacífico. Desaparecido Balboa fue necesario esperar hasta que el Licenciado Don Pascual de Andagoya, regidor del Cabildo y Visitador de Indias en Panamá, emprendiera su primera expedición.

La fundación de Buenaventura se llevó a cabo el 14 de Julio de 1540 por Juan de Ladrilleros, según orden del adelantado Don Pascual de Andagoya, en la isla de "Cascajal", como la designaban los naturales de la tribu de los "Buscajáes". La ciudad recibió su nombre por haberse fundado el día de la fiesta de San Buenaventura y por la tranquilidad de la bahía.